1905年，在日本右翼組織黑龍會份子內田良平等人撮合下，廣東人佔多數的興中會（孫中山、胡漢民、汪精衛等為首），與湖南系統的「華興會」（黃興、宋教仁、陳天華等為首）、江浙系統的「光復會」（陶成章、章太炎、蔡元培、秋瑾等為首）等革命團體，在東京聯合成立「中國革命同盟會」（後為避免日本政府反對，改名為「中國同盟會」，簡稱「同盟會」）。孫中山被推舉為總理，黃興等任庶務，下設執行、評議、司法三部，揭櫫「驅逐韃虜，恢復中華，創立民國，平均地權」的革命綱領，成為晚清最重要的革命機關。同盟會以《民報》作為機關刊物（原名《二十世紀之支那》，本華興會機關刊物）。《民報》在章太炎、陶成章主編下，由胡漢民、汪精衛等人執筆，曾與主張「保皇」，由康有為、梁啟超執筆的《新民叢報》展開激烈論戰。同盟會曾在中國多處發動起事，試圖推翻清政府，同樣皆未成功。自1906年起，同盟會聯合地方會黨，先後發動了萍瀏醴起事（1906年12月）、黃岡起事（1907年5月）、七女湖起事（1907年6月）、欽廉防城起事（1907年9月）、鎮南關起事（1907年12月）、欽廉上思起事（1908年3月）、雲南河口起事（1908年4月）、廣州新軍起事（1910年2月）和「三二九」黃花崗起事（1911 年4月27日）。其中，1906年萍瀏醴起事，犧牲黨人及其親屬逾萬人；黃花崗起事，折損者多為同盟會骨幹成員。至於1911年10月爆發的武昌起事，雖有同盟會會員參加，但並未起領導作用。事實上，同盟會係由聯合各派系組織而成，包羅甚眾。因此，自1906年起，便不斷發生內部紛爭。1907年春，更因孫中山未經眾人同意，收受日本政府資金，爆發了嚴重風波。原光復會若干成員，遂於於1910年2月在東京「重建」光復會，擁章太炎為會長，正式與同盟會分家。1911年7月，宋教仁等部分同盟會員鑑於廣州「三二九」之役的失敗，又在上海設立「同盟會中部總會」，號為同盟會分支，實為對同盟會本部不滿而採取的獨立行動，對總理孫中山的領導亦予否定。在這一連串內訌中，孫與汪精衛、胡漢民等人另組南洋總部；而黃興則繼續支持孫中山。1911年10月，辛亥革命爆發。11月，同盟會總部遷返上海。中華民國南京臨時政府成立後，再遷南京。1912年8月，由革命秘密組織改組為公開政黨形式的「國民黨」。