甲午戰爭後，日本為改變中國人的仇日心態，不斷派人至中國，遊說官僚與知識份子。光緒二十三年（1897），日本參謀本部特派神尾光臣、宇都宮太郎遊說湖廣總督張之洞：「中（中國）東（日本）係同種同文同教之國，深願與中國聯絡。」光緒二十四年（1898）正月，神尾光臣等人又遊說譚嗣同：「彼我本兄弟國，…我不聯貴國，將誰聯？」甚至在馬關條約簽訂後曾發動「公車上書」，主張繼續對日本作戰的康有為，也在光緒二十四年與日本駐華公使矢野文雄討論準備召開「合邦大會議」。光緒二十四年（1898），康有為向光緒進呈《日本變政考》，促成光緒皇帝下詔「更新國是」，開始了戊戌變法運動。變法期間，日本前首相伊藤博文至中國訪問。伊藤與英國傳教士李提摩太向變法派領袖康有為提議「中美英日合邦」。於是，變法派官員楊深秀上書光緒皇帝：「臣尤伏願我皇上早定大計，固結英、美、日本三國，勿嫌合邦之名之不美。」另一變法派官員宋伯魯也上書言道：「渠之來也，擬聯合中國、日本、美國及英國為合邦，共選通達時務、曉暢各國掌故者百人，專理四國兵政稅則及一切外交等事，別練兵若干營，以資禦侮。…今擬請皇上速簡通達外務、名震地球之重臣，如大學士李鴻章者，往見該教士李提摩太及日相伊藤博文，與之商酌辦法。」不過，這一項建議由於戊戌政變的發生，慈禧太后重新訓政，因而中止。戊戌變法失敗後，日本公使館並且協助康有為的學生梁啟超逃往日本。八國聯軍之後，清廷為了收攬民心，重新推動新政。當時在軍事、警政、監獄、司法等方面的改革，多取法日本的經驗。日本在日俄戰爭中擊敗俄國，許多中國知識份子認為是日本「立憲」的政治體制較俄國專制政體優良的結果，因此許多知識份子開始鼓吹立憲。清廷在民意的壓力下，派遣鎮國公載澤等五大臣出國考察，日本即是前往考察的國家之一。光緒三十二年（1906）載澤等人返國後，認為立憲可使皇位永固，建議憲法仿日本，實業仿日本及德國。清廷因此宣佈預備立憲，以緩和革命排滿的壓力。不過，清廷缺乏推動政治改革的誠意，宣統三年（1911）仿日本內閣制成立的「責任內閣」，以慶親王奕劻為內閣總理大臣，被譏為「皇族內閣」，百姓大失所望，清廷也在隨後的辛亥革命中垮台。