中國最早的教會醫學校為博濟醫學校，成立於1866年。繼博濟醫學校後，許多教會紛紛成立醫校，較為重要者有：1884年抗州成立廣濟醫學校。1887年英國倫敦會於成立愛麗斯紀念醫院，並於同年8月成立醫學校(香港西醫書院，香港大學醫學院的前身)，第一屆有兩名畢業生，其中之一是孫中山。1889年南京成立斯密紀念醫院醫學校。1890年濟南成立濟南醫學校。1891年美國監理會在蘇州成立蘇州女子醫學校。1894年成立蘇州醫學校(蘇州女子醫學校併入，1910年停辦)。1896年，美國聖公會在上海聖約翰大學設立醫科。1899年，美國長老會在廣州成立夏葛女子醫學校。1903年，上海成立大同醫學校，1917年併入齊魯大學醫學院。1904年，耶穌會成立震旦大學，1909年遷至上海並建立醫學院(1952年合併於上海第二醫學院)。1904年，英美教會在濟南成立共和道醫學堂，1917年改組為齊魯大學醫學院。1906年，英美教會在北京聯合創辦協和醫學堂，1915年由美國洛克菲勒基金會(羅氏基金會)及羅氏駐華醫社接管，1908年，成立北京協和女子醫學校；1923年合併於齊魯大學醫學院；1906年，漢口成立大同醫學堂，1917年合併于齊魯大學醫學院；南京成立金陵大學醫科。1909年，廣州成立赫蓋脫女子醫學專門學校；漢口成立漢口協和醫學校；1910年，南京成立華東協和醫學校……等等。據統計，1900至1915年，整個中國已建立了323所教會醫學院校，可見近代教會對於西醫教育發展的重大影響。