現行學制是學士教育學制，而學士教育又分為「單學士學制」及「雙學士學制」，但兩者的畢業生同樣都可獲得醫學士的學位，也都具有參加醫師考試的資格，因此兩者的教育目標及終程結果完全相同，不同的僅是入學資格及修業年限而已。對整個社會來說，訓練成本以修業年數最短、早日進入醫師市場的學制較為經濟。而「單學士學制」較「雙學士學制」更有效率，因「單學士學制」由高中畢業算起，訓練期間僅需七年，「雙學士學制」則訓練期間最少需要九年。十一所醫學系都採用「單學士學制」，招收高中畢業生，修業年限七年。「雙學士學制」，如私立高雄醫學大學的「學士後醫學系」，招收已有學士學位者，修業年限五年，畢業後授與醫學士學位，並具參加醫師考試的專業資格。「學士後醫學系」每年在私立高雄醫學大學單獨考試，招收具有學士學位的畢業生，第一、二年為基礎醫學，第三、四年為臨床醫學，第五年為臨床實習，亦即「學士後醫學系」的課程，與「七年制單學士學位」的醫學「本科」課程可說是大同小異。依照中西醫教育及學士後教育的差異，臺灣公私立醫學院的醫學教育制度可細分為五種：(1)醫學系：七年制，錄取高中畢業生，先修二年的基本科學及人文科學課程，再修各二年的基礎醫學及臨床醫學課程，第七年則為臨床實習課程。這一學制目前廣泛採行。另外自1998年起台大醫學院醫學系試辦六年制學制，學生畢業後再接受一年的畢業後訓練，為現階段醫學教育改革的一環。(2)學士後醫學系：五年制，錄取大學畢業生，修習二年的基礎醫學及二年的臨床醫學，第五年為臨床實習。這一學制目前為高雄醫學大學學士後醫學系採用。(3)中醫學系：類似七年制醫學系，但另修中醫學課程，這一學制目前被中國醫藥大學中醫學系採用。(4)學士後中醫學系：類似五年制學士後醫學系，只修習最低學分之基礎醫學，主要修習臨床中醫學，所修習的臨床西醫學分很少，畢業後只能考中醫執照。(5)中醫學系加修醫學系：八年制，係中國醫藥大學中醫學院中醫學系所採用，使學生加修醫學系，進行長達八年教育的雙主修教育。