明清時期，宗族成為基層社會的主幹，自然會受到政府的注意，並成為籠絡的對象，宗族和官府之間也就互動頻繁。由於明清時期視理學為官方正統的思想，提倡忠義孝悌的儒家倫理教化觀念，士大夫們往往將這些觀念加諸族譜當中，於是產生了族譜的政治化傾向。皇帝頒布的諭旨，常是族譜的重要內容。朱元璋建立明朝後，為了穩定社會秩序，頒布了下列這個諭旨：「孝順父母，尊敬長上，和睦鄉里，教訓子弟，各全生理，勿作非為。」此即是明初有名的「聖諭六言」，這個聖諭發布之後，各地宗族紛紛把此聖諭內容放在族譜之中。虎墩崔氏族譜的族規當中，首先便放入了聖諭六言，並要求族人時時誦讀，遵守規定。而王士晉在《宗規》裡便寫到「聖諭當遵。」清朝建立之初，統治者常常以明朝治國的經驗做為施政的鑑鑒，於是在順治九年時，將聖諭六言頒布各省，所以清初各地的宗族族譜中，也經常納入聖諭六言。不久之後，清朝也頒布了屬於自己的聖諭。康熙九年向全國頒布了「上諭十六條」，其內容如下：敦孝弟以重人倫 篤宗族以昭雍睦和鄉黨以息爭訟 重農桑以足衣食尚節儉以惜財用 隆學校以端士習黜異端以崇正學 講法律以儆愚頑明禮讓以厚風俗 務本業以定民志訓子弟以禁非為 息誣告以全善良誡匿逃以免株連 完錢糧以省催科聯保甲以弭盜賊 解仇忿以重身命從內容中可以看出，清朝將把教化視為治國的重點之一。雍正皇帝十分重視聖諭十六條，為其進一步加以解釋，形成數萬言的《聖諭廣訓》一書，並在雍正二年頒布天下。這些聖諭公布後，各地宗族紛紛將其納入族譜的內容，湖南江永的《義氏族譜》、四川儀隴的《胡氏宗譜》甚至不惜成本，將《聖諭廣訓》的全部內容放入族譜當中。在這種背景之下，士大夫們配合政府宣傳教化，並將族譜視為改造社會的工具，這是家族與政府互動的重要方式。因此宗族在編修族譜時，開始展現出想要族人遵從的內容。例如為了加強教化，要求婦女嚴守貞節、將充當賤業的族人削名、倫理觀念走上法制化等。在倫理法制化方面，明清時期的族譜大量提倡倫理說教，同時對於實行者採取獎懲措施。明清時期，家族與政府的互動，最顯著的表現在於族譜的政治化，許多家族在政府頒布政令後，主動將其內容納入族譜之中，並要求族人遵守，成為政府施政時有力的幫手。