教會累積大量的財產與權勢，內部逐漸趨向腐化，尤其到了中古後期城市興起之後更加嚴重。原來掌管地方教會財產行政等權力的高級教士，如大主教、主教、修道院長等，由於受到城市商人牟利的影響，就常利用職權挪用教會公款來經商，生活極其奢糜。至於部分低階教士如神父就開設酒店、賭場來增加個人收入，正常的宗教職務反而受到忽略。甚至不少教士還娶妻納妾，嚴重破壞教規。領導教會的首腦人物教皇本身的腐化，其影響更大。教皇亞歷山大六世的情婦數人，並生有子女八人，他更不惜利用權勢為子女取得封地。教皇利奧十世不惜以出賣教職為手段來籌措聖彼得大教堂的建設經費。以上種種教會高層腐化的現象，更讓許多人士提出教會改革的要求。