明初商品交易稅的稅率，大抵是三十分之一。明朝並在全國各地設「稅課司（局）」400餘所。此外，各地又有「竹木抽分局」，向販賣竹木的商人徵收竹木實物，以供官府造船、建築所需的木材。嘉靖（1522-1566）以後，竹木抽分局改以徵收貨幣為主。又有「河泊所」，向漁民徵收「魚課米」、「魚課鈔」等捕魚稅。對於國內河道上的商船，明朝則設置「鈔關」。「鈔關」始設於明宣宗宣德四年（1429），在南北兩京之間的漷縣、臨清、濟寧、徐州、淮安、揚州、上新河、滸墅、九江、金沙洲、北新等地設置鈔關十餘處，向商船徵收「船料」，亦即按貨物的重量徵收船稅，其標準為「每船一百料（一料相當於一石），收鈔一百貫。」當時因明朝發行的「大明通行寶鈔」貶值嚴重，所以鈔關以收鈔為主，以抬高寶鈔的價值。