1986年，兩伊戰爭再度激烈。伊朗一反過去打消耗戰的方針，力爭速戰速決。1986年2月初，伊朗出動9萬餘人的兵力，發動了規模較大的代攻勢，攻克了伊拉克南部重要的港口城市。與地面戰場相呼應，1986年，兩伊「襲船戰」一再升級，遭到襲擊的船隻達106艘，其中有28 艘進出科威特港口的船隻遭到襲擊，同時兩伊都有對對方的石油平臺進行攻擊。由於兩伊「襲船戰」影響到非交戰國的利益，科威特於1986年11月和12月，先後向聯合國的5個常任理事國美國、蘇聯、中國、法國和英國提出租船和護航要求。蘇美相繼同意?科威特油輪護航，並以此?由不斷向海灣派遣軍艦，從而使原來就很緊張的海灣局勢增添了更大的危險。?避免戰爭進一步升級，聯合國安理會於1987年7月20日一致通過了第598號決議，要求兩伊雙方立即停火。 598號決議通過後，由於兩伊積怨已久，在停火問題上立場各異，分歧較大，誰也不願主動做出讓步，因而聯合國598號決議遲遲得不到貫徹落實。1988年，是兩伊戰爭出現重大轉折的一年。雙方使用了數百枚導彈襲擊對方的城鎮，掀起了一場空前規模的「襲城戰」。在1988年2月29日至 4月20日雙方展開的「襲城戰」中，戰術導彈成了主要武器。雙方共發射導彈266枚：其中伊拉克189枚，伊朗77枚。此後，在相持中，伊拉克漸漸占了上風，4月17日，伊拉克軍隊對法奧地區的伊朗守軍發動了代號?「齋月」的攻勢，經過兩天激戰，於18日下午全部收復被伊朗佔領兩年之久的法奧地區。伊朗在欲戰不能，欲罷不忍的境況下，被迫於 1988年7月18日宣佈，同意接受聯合國安理會598號決議。8月20日，兩伊雙方實現停火，長達8年的兩伊戰爭終於落下了帷幕。兩伊戰爭中，雙方共死傷人員100萬人以上，消耗直接戰費2000億美元，戰爭使兩國經濟均遭嚴重破壞。戰爭使兩個國家都受到慘重損失，經濟發展停滯，石油出口驟降，死傷人數以百萬計。伊拉克因此也背負了大量的債務，僅欠科威特的債務即達140億美元。這也是後來海珊入侵科威特的原因之一。戰爭結束時，兩國的分界線恢復到了戰前的情況。這場戰爭是二戰以後傷亡最大的戰爭之一，僅次於越戰和韓戰。具體傷亡數字有很多說法，一般認為死亡人數為一百萬人左右。伊拉克正規軍隊由戰前的24萬人發展到戰後的120萬人，但在後來的美伊戰爭中被美軍全數消滅。