1802年阮福映統一越南自稱大越皇帝，其幼時曾被法傳教士所救，其後也獲得傳教士協助，因此其在位時傾向親法，天主教在此時快速拓展。然其子明命皇帝卻走向反西方、反傳教士之路，在崇尚儒家的情況下，教案頻傳。嗣德皇帝是迫害傳教士最嚴厲的時期，然有學者指出，這些迫害可能是過分被激化。然而法國人卻因此作為藉口，攻打越南。1858年法西聯軍遠征越南，在西班牙退出後，法國仍持續作戰，1862年法越簽訂《西貢條約》，獲得越南南部嘉定、定祥、邊和三省。法國將其稱為稱為交趾支那(Cochinchine)。1873年法國與中越邊界的中國亡命之徒發生戰爭，其中被黑旗軍打敗，1874年簽訂條約，開放通商口岸外，法國獲得治外法權。1881年法國攻打越南，征服的結果是使越南在1883年簽訂《順化條約》，越南成為法國的保護國。越南因此訴請中國協助，然而1885年的中法戰爭的結果是訂《中法天津條約》，中國承認法國對越南的保護領。法國統治越南後，越南爆發大大小小反法運動，1909到1913年間，法國捕殺抵抗運動的領袖。1920年代出現許多受法國教育出身的民族主義領袖，受到日本崛起與中國革命的影響，許多反法祕密組織紛紛出現，最著名的為師法中國國民黨的越南國民黨，其在1930年代的起義失敗，被法國剿平。然而胡志明所領導的印度支那共產黨(又譯東洋共產黨)然仍持續起義，雖然1931年被捕，仍持續活動並地下化。柬埔寨位於越南與暹邏中間，經常在安撫兩國而陷入戰亂，甚至因此喪失土地，1853年請求法國保護，1863年法國對柬埔寨成立保護領(Protectorate)。1867年法國與暹羅解決柬埔寨問題而簽訂條約，暹羅承認法國在柬埔寨的主權，然暹羅對柬埔寨西部兩省有主權。1884 年法國迫柬埔寨國王簽約，使柬埔寨正式成為法國殖民地。柬埔寨王子賽偉達(Si Vettha)因此起來叛亂，直到1892年被平定。1887 法國將柬埔寨、越南組成印度支那聯邦(Union Indochinoise)。寮國在13世紀建立瀾滄王國，19世紀的寮國為兩個國家，南邊為永珍，北邊為鑾勃喇邦，永珍1827年為暹羅消滅，因此鑾勃喇邦向越南靠攏，希望免除暹羅入侵。1880年代末期，法國欲獲得湄公河以東土地(寮國)，在英、法、暹羅三國勢力衝突下，1893 年法與暹羅簽訂《暹法條約》，寮國正式成為法國殖民地，成為印度支那聯邦一部分。