20世紀以前，教會所主持的西醫教育，無論是過渡形式的教學，還是初具規模的醫學校，教學格局基本類似，只是程度深淺不同而已。這一時期中國的西醫教育僅初具規模，開辦的學校招收的學生人數不多，但其教育形式，內容和品質與歐美的教育水準相比較差距並不很大。1912年中華民國成立，教育部很快頒佈了一些改革教育的決議和法令，廢除舊氏教育，建立近代教育體系。1912年10月，教育部公佈《大學令》〔壬子學制)，1913年經修改後，規定醫科分醫學、藥學二門，其修業年限，醫學預科一年，本科四年；藥學預科一年，本科三年。該學制一直執行到1922年「壬戍學制」公佈為止；但這個新學制未包括中醫教育，遭到中醫界的反對。1915年9月，北洋政府又公佈高等文官考試命令，凡在國內外高等學校修習各項專門學科三年以上畢業，並獲得文憑者，皆可參加考試。考試分為一、二、三、四等，報考醫科的第二試為基礎醫學，第三試為臨床醫學。報考藥科的第二試為物理、化學、調劑學、生藥學、制藥學等科目，第三試則為各科的實際操作。1922年11月，北洋政府公佈新學制(即《壬戍學制》)規定：大學分為4個層次：第一、大學：可設多科或單科，取消預科，學制4至6年，並規定醫科至少5年。第二、專科學校：學制3年，如超過3年，待遇與大學同。第三、大學和專科學校可設立專修科，年限不定。第四、大學院(即研究生院)：招收大學本科畢業生，年限不定。1924年2月公佈《國立大學條例》，規定國立大學修業年限為4至6年，選科制，考試及格者發給畢業證書，大學院畢業授予學位。北洋政府期間頒佈的學制、章程等，主要是抄襲日本的學制，並適當地加入了一些中國的教育內容，規定了修業年限與必修科目。