1930年，華藏軍隊對峙下，爆發大白事件，起因在於寺產糾紛。甘孜縣屬白利土司白利村內的亞拉寺，照例由土司撥15戶供亞拉活佛支用，該活佛因與大金寺僧人交好，遂將寺產及戶民轉贈，雙方爭執不休，最後上達川軍指揮劉文輝，劉氏遣兵佔領亞拉寺，大金寺僧人呈報駐德格藏軍，康藏戰火點燃。1931年5月，藏軍攻陷甘孜、瞻化二地，由於九一八事變，國府專員於11月擬定暫時停戰協定，承認藏軍的戰果，協議傳出後，劉文輝不表接受，藏人則認為應行重劃地界，此事遂成懸案。1932年1月，青海玉樹地區又因寺產糾紛，爆發衝突，國府命劉文輝分路進擊，8月底，藏軍退至金沙江以西，國府本著「攘外必先安內」的綱領，制止康青兩軍的續進，華藏兩方於1932年10月8日，議結〈岡拖停戰協定〉，但藏方仍藉故滋事，直至1934年5月，大金寺僧人終獲得善待，康藏糾紛始告平息。1933年12月17日，達賴十三圓寂，為多年來的爭端帶來一線曙光，國府遣派黃慕松為專使入藏致祭，追封達賴為「護國弘化普慈圓覺大師」，並負有與藏方洽談歸屬之事，但無成效，不過藏人同意人員留駐拉薩，作為雙方聯繫之用。班禪九世離藏後，無時不設法返藏，但受阻於達賴，不能如願。達賴遺囑雖歡迎班禪返藏，然而噶廈內部意見不一，國府則在1935年準備班禪的返藏活動，為之成立行署與衛隊，1936年12月，行抵青海玉樹，藏方傳來攔阻的訊息，至七七事變後，國府暫緩班禪入藏，班禪受此衝擊，於1937年12月1日圓寂。達賴十三圓寂後，1934年，噶廈三路尋訪靈童，1938年9月，傳來西藏尋獲二名、西寧一名的消息，藏人希望能將西寧靈童送至西藏參加典禮，國府撥付護送費十萬元，令馬步芳派兵護送，但為馬氏刁難，交涉經年，始於1939年7月成行，10月初至拉薩。國府派遣蒙藏委員會吳忠信委員長等人自海道入藏，1940年1月，至拉薩，先為熱振活佛等人冊封授勳，再參加達賴十四的坐床典禮。吳氏入藏的另一成就是設立蒙藏委員會駐藏辦事處，強化國府與西藏的連絡，另外，使藏人同意將班禪靈柩運回扎什倫布寺。1940年7月，日本在英國的支持下，實施封鎖中國的計畫，10月英國再次開放滇緬公路，加深國府積極籌闢國際通道的決心。1941年初，美國提議，由中英美三國合作，建造經西康至印度塞地亞的鐵路。路線的開闢可分為南北兩線（如附圖），隨後以康印之間地形特殊，軍需物資籌集困難，改為修建公路。7月與藏方洽談，提出財政補助的方法，加上英國的示意，藏方同意給與勘測隊的協助，不久英國指稱中國放棄航測，改為陸測，由藏人自決，藏方破壞河橋，調兵扼守，北線勘測因此中斷。隨著國際局勢的變化，康印公路的修築也應聲而止。