明清時期，長江下游的圩田水利技術，向長江中游大規模發展，當地人稱為「垸田」。垸田是在河流或湖泊的岸邊，修築堤防將水隔開，接著在堤岸上設置水閘，形成一個獨立的水利系統，其興建方式有兩種，早期多是先墾田後築堤，晚期則是先圍堤後墾田，其堤岸也從矮小的土堤，發展成為大型的石堤。此時期，在兩湖流域，都有大片垸田的分佈，到明代中期以後，成為當時主要糧食產地，而有「湖廣熟，天下足」的說法。兩湖垸田興建，以湖北荊江和湖南洞庭湖一帶最為集中。明代前期，華容（今湖南華容縣）有垸田四十八所，其中著名的垸田有安津、蔡田，但到了明代末期，垸田已成長到一百多所。清代以後，洞庭湖地區垸田水利發展迅速，至乾隆十二年（1747 A.D.），因開墾過多，影響洪水的排蓄，使得官方明令禁止圍墾。但禁令無法嚇阻垸田的增加，如道光十二年，又查出禁修的私垸三百零九處。珠江三角洲的堤圍，又稱為「基圍」，在宋代就已經出現。早期的堤圍修築，多是先墾田後築堤，後來則變成先築堤後墾田，而堤圍的大小不一，大者有二十多萬畝，小者只有數十畝。明清時期，珠江三角洲的基圍快速發展，不僅沿著東、西、北三江的沿岸發展，更進一步向濱海地區擴張。清代的堤圍，又較前代成倍數增長，如光緒年間（1875-1908 A.D.）的統計：三水（今廣東三水市）有堤圍三十五處；南海（今廣東廣州市）有七十六處；順德（今廣東順德縣）多達九十一處。其中最著名的堤圍為「桑園圍」，相傳建於北宋，歷經明清的增修，堤長達一萬四千七百多丈，有田一千八百頃。