國民黨軍隊的編組，係以黃埔軍校為核心，逐步地擴大規模。1924年9月起，廣州國民政府以黃埔軍校師生為基幹，依序建立黃埔軍校「教導團」、黃埔「校軍」、「黨軍」，未幾，1925年8月再擴編為國民革命軍第一軍。這支部隊設置了各級「黨代表」，掌政治監察職責，與部隊主官「享同等權力」，並持有軍事命令的副署權。不惟如是，黨代表亦負責督理「政治部」進行軍中政治工作。在統一廣東的戰事中，國民黨人已獲取豐碩的軍隊政工經驗。隨後，其餘粵湘滇桂系統的部隊，也陸續仿黃埔系第一軍模式，建立政工組織。在廣州政府組建新軍的過程中，藉由拓展「黨軍」的影響力，蔣介石迅速崛起，晉身為國民黨的「中央軍事領袖」。隨著統一廣東、出師北伐，蔣介石的聲望漸次升高，全國知名度竟一舉超越了國民黨元老胡漢民、汪精衛諸輩。1926年7月1日，國民革命軍總司令蔣介石以軍事委員會主席身份，發佈「北伐部隊動員令」，令各軍向湖南集中，期先肅清湖南境內的吳佩孚部隊。同時，國民黨改選蔣為中央常會主席、政治會議主席，職務分別由張靜江、譚延闓代理。蔣似乎已集黨、政、軍大權於一身。不過，在初期，國民黨軍隊的高級軍官，大部分仍由保定軍校畢業、或出身自黃埔軍校的教官者擔任。至於黃埔軍校畢業的青年軍官，猶待進一步歷練，仍以出任中階職務為主。北伐出師後，負責正面突破武漢的主力是粵、桂、湘系統的第四、七、八軍。至於黃埔系地一軍，一部份隊伍在何應欽率領下，暫對福建採取守勢。1926年9月底以後，該部方才開拔北上，掃蕩閩省，直撲浙東。未久，蔣介石命何應欽為東路軍總指揮，繼續乘勝追擊。可以說，此後蔣對江浙一帶的控制，亦有賴於黃埔系軍隊的實力保證。1926年底，北伐軍底定湘鄂贛三省，國民政府與國民黨中央黨部遂由廣州遷往武漢。然而，蔣介石驚覺武漢中央已被共黨份子「把持」；共產黨在各地主導的民眾運動，亦有「過火」之勢。但另一方面，許多國民黨人也日滋不滿蔣介石的大權獨攬，認定是「軍權」壓倒了「黨權」，寧願與共產黨合作，堅定支持武漢政權。這最終導致國民黨「寧漢分裂」的格局。就軍事上講，武漢政權的主力軍隊是粵系的第四軍、唐生智的第八軍；而南京方面，則賴黃埔系第一軍、和桂系第七軍的支持。大抵而言，黃埔系軍隊在組織、紀律、裝備、後勤給養上，較地方部隊為優。許多地方軍人，也相繼投靠蔣介石。北伐中期開始，國民革命軍的部隊數量開始巨幅膨脹。蔣在國民黨的權力地位，更是有賴於黃埔軍系的茁壯。