魏晉時期，大體保留了與商業有關的各種賦稅，如關津之稅；另外也對開店商人徵收市租，具有營業稅性質，亦有租用市肆店鋪租金的性質。三國時代對鹽、鐵也恢復專賣或部份專賣，極為重視鹽鐵之利，曹魏和孫吳專賣範圍另擴及酒類。西晉延續管制策略，對於鹽和鐵的管制極嚴格，惟製鐵業私營也所在多有。東晉南朝的市租也稱市稅，商稅以與關津相關的稅收，最為繁多，如搭浮橋的「桁渡稅」和使用方便商旅設施的「牛埭稅」。另外，也在魚池或產魚場所設置的魚稅，又有「估稅」這種兼具商品交易稅和契約稅雙重性質的稅目產生，各式稅目均成為財政的收入來源之一。相較於東晉南朝，北朝的關市之稅則非經常性徵收，只佔整體財政收入的一小部份，倒是較重視鹽、鐵、酒三種產業，多採官營、專賣為主。由於戰亂頻仍，正規的田租與調綿絹不足以應付開支，正稅之外的橫調、橫賦在所難免。曹魏時代還比較罕見，西晉以後越來越多，北朝各代的橫調、橫賦都很常見，如北魏孝文帝振興三年(473)一年之內就在七月和十月徵收兩次。北魏前期常為軍國急需而臨時征發，數額極高，遠遠超出一般民戶的承受能力。因應國家財政匱乏，更有長年徵收的定額「雜調」，後來又加收「軍糧」等項目。東晉南朝的橫調、橫賦名目繁多，調奴婢僮客、調工巧、調車牛驢馬、調米麥、調雜物等，雖都稱「調」，但其實都屬於橫調、橫賦。這些橫調、橫賦原本都是起於臨時的，但久而久之後就「逐為常典」。東晉南朝的橫調、橫賦，除了由中央調發以外，軍府和地方州郡長官也常自行征調，這對民戶的負擔而言，往往甚於正調。