清帝國將臺灣納入版圖後，針對平臺將領論功行賞，其中統帥福建水師提督施琅封靖海侯。雖然如此，清帝國對於臺灣領土的處理並無固定的方針，因此對於臺灣棄留的問題，引發一場爭議。當時朝中不少人認為臺灣「孤懸海外，易藪賊。欲棄之，專守澎湖。」或謂：「海外丸泥，不足為中國加廣。裸體文身之蕃，不足與共守。日費天府金錢於無益，不若遷其人而棄其地。」但福建總督姚啟聖反對上述主張，認為臺灣若棄而不守，「勢必仍作賊巢」。後來，康熙皇帝命令派往福建的工部侍郎蘇拜會同福建總督姚啟聖、巡撫金鋐及施琅等人，會商臺灣的棄留，最終認為臺灣「留恐無益，棄虞有害」，所議不一，未能獲得結論。