林爽文之役後，由於清廷嚴辦天地會，各地天地會組織紛紛逃散，原本有極大勢力的福建、臺灣兩地，有關天地會的名稱已罕能見到。由於福建與廣東相鄰，基於謀生需要，閩粵間即存在著大量的移民人口；同樣的，江西與福建、廣東接壤，亦有許多人從廣東湧入江西，可以說，這些地方間的流動人口至他地後為求自保，或結拜為兄弟，或邀集同鄉結盟拜會，為日後秘密會社的興盛提供主要的溫床。嘉慶初期，天地會的勢力已明顯轉移至廣東、廣西及江西等省份；嘉慶十七年(1812)以後，雲南、湖廣等地的秘密會社相繼出現；嘉慶二十一年(1816)以後，貴州也已存在秘密會社的蹤跡。天地會、添弟會名目，普遍見於廣東各府廳縣，嘉慶年間以來，其他秘密會社名稱亦相繼出現。嘉慶七年(1802)八月，廣東惠州府博羅、歸善、永安一帶，則爆發了嘉慶年間規模最大的天地會起事。首先由陳爛屐四在博羅起事揭開序幕。當時，博羅縣存在著嚴重的土客對立，陳氏常受到當地士紳的欺凌，為了求得兄弟相幫、免受欺凌，陳氏遂加入天地會，並不斷邀人入會。由於當時生活貧困的農民及游民的大量湧入，他們對現存統治秩序感到極端不滿，強烈希望可以藉抗爭來改變自身的悲慘境遇，而陳氏便被推為領導者。嘉慶七年，陳氏率領會眾與清朝官兵發生激烈衝突，最後終於被俘、凌遲處死。湖南因與廣東、廣西等省接壤，兩廣秘密會社隨著流動人口的湧入而傳佈於湖南境內，湖南早期的各種秘密會社，無論是秘密會社名目、性質及其內部組織，都與閩粵系統極為相近，可以說是閩粵秘密會社的延長。道光二十七年(1847)，湖南人雷再浩因所居地處偏僻，恐遭人欺侮，於是年和朋友組織棒棒會。棒棒會其實是青蓮教與天地會的聯合體，由於天地會在兩廣、湖南的廣泛傳播，湖南等省的青蓮教竟出現與天地會融合的趨勢。最明顯的標誌是，青蓮教奉天地會始祖萬雲龍為總頭目，還設立忠義堂。棒棒會成立後，許多貧苦農民紛紛加入，遂引起官府的注意，雷氏不得不率眾與清軍交戰，最後被俘犧牲。