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中國與日本為一海之隔的鄰邦。由於漢文化對日本的影響極深，因此日本在明治維新以前的醫藥文化，基本上一直是以漢（中）醫漢藥為主體。早在南北朝時，中國就贈予日本《針經》一套；西元562年，吳人知聰(僧人)攜帶《明堂圖》和其他醫書東渡日本。西元608年，日本推古天皇派遣藥師惠日等人到中國學習醫學，並帶回《諸病源候論》等重要醫籍。中日真正大規模的醫藥交流始自唐朝。西元701年，日本制定的醫藥職令——《大寶律令?疾醫令》，以唐代醫藥制度作為藍本。《疾醫令》規定，醫學生學習醫藥，都要以《素問》、《黃帝針經》、《明堂脈訣》、《甲乙經》、《新修本草》等中醫經典為必讀課本。
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