西元1661年，順治皇帝病逝，由他生前指定的三皇子玄燁即位，即康熙皇帝。當時玄燁只有八歲，根據順治帝的遺詔，由上三旗的四名貴族作輔政大臣，幫助皇帝處理國家大事。這四名輔政大臣是索尼、蘇克薩哈、遏必隆和鰲拜。其中又以鰲拜最為跋扈，他掌握兵權，自恃功高，盛氣凌人，連皇帝都不放在眼裡。鰲拜把自己的兒子和親信都安插在朝廷的重要職位上，這對身為太皇太后的孝莊來說，無異是將愛新覺羅氏辛苦營建的政權，逐步落入他人之手。康熙皇帝到十四歲那年，宣佈親政。不久，索尼病死，康熙皇帝精密的計畫之後，終於成功的剷除鰲拜。而護孫心切的孝莊太皇太后，除了悉心教育幼主，其後則逐步歸政於帝。無怪乎康熙曾真情的評價他的祖母：「設無祖母太皇太后，斷不能敦有今日成立。」