現階段的醫學教育以「七年制醫學士學制」為主流，修業年限為七年，包括兩年預科、兩年基礎醫學、兩年臨床醫學及一年實習醫學，為目前十一所醫學系所採用，但各校略有差異，如台大醫學院醫學系的第一、二學年為通識教育與醫預科課程，第三學年為基礎醫學課程，第四學年為基礎與臨床醫學整合課程，第五至七學年為臨床實習課程。另外自1998年台大醫學院醫學系起試辦二階段學程，縮短一年的課程成為六年制，畢業後再接受一年的畢業後訓練，為醫學教育改革的一環。課程部分，各校實際的安排也略有差異。兩年的預科課程稱為「通識教育」，包括國文、英文、歷史、體育、軍訓、哲學概論、社會學、普通心理學、醫學史、醫學概論、普通化學、分析化學、普通生物學、微積分、普通物理學及有機化學等。其他課程包括醫學人文 (如陽明、高醫、臺大、長庚、北醫)、醫學法律/法學概論 (高醫、國防、中國)、電腦概論/醫用電腦 (中國、北醫)、藝術概論 (中國)、醫學文獻利用/醫學圖書館資料 (北醫)、醫學生涯及臨床溝通演練 (成大、中國、北醫)。第三、四年級為「基礎醫學」課程，包括解剖學、組織學、胚胎學、生理學、生化學、病理學、醫學遺傳學、微生物學、免疫學、公共衛生學 (含生物統計學、環境醫學、流行病學)、藥理學、寄生蟲學、臨床診斷學、實驗診斷學等。第五、六年級為「臨床醫學」課程，包括內科學、外科學、婦產科學、小兒科學、麻醉學、法醫學、急診醫學、復健醫學、精神醫學、神經學、皮膚科學、骨科學、眼科學、泌尿科學、耳鼻喉科學、家庭醫學、放射線學、臨床病理學討論、門診醫學等。其他課程包括醫學倫理 (陽明、國防、長庚、北醫)、醫院管理/行政管理 (陽明、國防、北醫)、醫事工程 (北醫)、牙醫學 (長庚) 等。第七年的「實習醫學」則在教學醫院臨床各科實習，包括內科、外科、小兒科、婦產科、神經科、麻醉科、精神科、家庭醫學科、皮膚科、泌尿科、眼科、骨科、急診科、放射科、耳鼻喉科、復健醫學科。