清代臺灣的書院，至中期以後慢慢出現官民倡建者。具體而言，即書院由地方官與仕紳合力創建。有的由地方官邀集仕紳創建者，也有仕紳呈請地方官領銜創建。此類書院如明志、文石、藍田、引心等書院，許多文獻中記載由地方官具名創建者，事實上背後發起者多為仕紳，如澎湖之文石書院。在此類書院中，管理階層由官民合組而成，官方代表多為低階之親民父母官，如知縣、通判、同知。地方官雖為主導之角色，但仕紳具有較大之權限，除可推薦書院院長外，對書院事務並負全責。基本上，此種官民倡建之書院，其分工與組織較符合理想之狀態。在官民倡建之書院中，除官憲、院長外，主要成員有董事，下轄監院、齋長、租趕、爐主、院丁等。監院為負責日常庶務的人員，有些不設監院設齋長。如設監院，下有齋長、書辦、號房、院役等輔佐之。大體上，臺灣書院人員職稱名目繁多，有總董、董事、當事、會東、監院、齋長、禮房、財帛、爐主、院丁、書丁、租丁、租趕、租差等。對學生的教導、財產的管理、會計的核報及總務的處理等，大多設有專職與專人負責。其中，院長負責學生的教導；總董、董事、當事、會東、監院、齋長、禮房及財帛等，或是管理書院財產兼理會計與總務，或是負責會計與總務，或是僅負責會計業務，或僅處理總務；爐主負責祭祀；院丁與書丁充當打雜；租丁、租建與租差負責徵收租穀。