約在公元前2000年間，印歐語族中的其中一支游牧民族阿利安人，經由今天的阿富汗和興都庫什山脈南下入侵印度北部，中間經過幾百年的激烈戰鬥，終於征服達羅毗荼人，而將印度北邊佔為己有。考古學家在摩亨約?達羅的廢墟挖掘到許多斷頭的骸骨，顯然曾遭大屠殺，而這屠殺或許就是阿利安人的傑作。另外，根據印度史詩《摩訶婆羅多》對摩亨約達羅城的誨滅有如此的描述；「南邊天空一道火柱沖天而起，比太陽更耀眼的火把天割成兩半，空氣劇烈燃燒，高溫使池塘裡的水沸騰起來，……房子、街道、水渠和所有的生命，都被這突如其來的天火燒毀了……。」《摩訶婆羅多》又記錄了一場人類大戰：「英雄阿斯瓦決定親自搭上飛馬那(空中戰車)，……操縱雷電的庫魯斯以神仙都害怕的武器，層層煙火像光柱一樣聳立著，那神秘的武器，鐵鑄石箭向死神的魔爪，把都市居民抓成一把灰燼。人的屍體因燒灼而變得面目全非，……」部分學者認為摩亨約達羅曾發生一次古代的核武戰，因為在遺址中發現輻射後留下的玻璃物質，這種玻璃化現像，只有在物質瞬間高溫融化後急速冷卻才造成。至今人們只有在熱核武器爆炸現場，如日本廣島原爆區，發現過這種物質。