西班牙人為了確保東亞貿易順暢和馬尼拉的安全，早就想要攻取台灣，只是沒有行動而已，等到荷蘭人於1624年8月佔領台灣後，在馬尼拉的西班牙人深刻感受到威脅。1626年，西班牙駐馬尼拉總督施爾瓦（Fernando de Siolva）派卡黎尼奧（Antonio Carreno de Valdes）率領部眾搭船到台灣。他們一行人沿台灣東海岸北上，先到三貂角（Santiago），然後再進入雞籠港（今基隆港），而後在基隆港內的社寮島（今和平島）舉行佔領儀式，並開始築城堡，將城堡命名為聖薩爾瓦多（San Salvador），（意思為「聖救主」），至此西班牙正式佔領台灣北部。1628年，西班牙人佔領淡水後建築城堡，命名為聖多明哥（Santo Domigo，後來荷蘭人曾加改建，之後為英國領事館，即現在的淡水紅毛城）。荷蘭人得知西班牙人佔領台灣北部後，即派兵攻打西班牙人，然而，因西班牙人防禦工事堅固，所以初期荷蘭人並沒有辦法將西班牙人驅逐出台灣北部。西班牙人佔領台灣後，由於日本對外貿易逐漸採取保守政策，來自日本的威脅也逐漸減少，對日貿易中斷，西班牙人又無法將荷蘭人驅逐出台灣，因此，傳教便成了西班牙人在台灣的重要目標。當時只要西班牙人的佔領區域到哪裡，傳教的範圍就到那裡。