民國建立後，袁世凱就任臨時大總統，不遵守臨時約法，大權獨攬。孫中山憤於袁世凱踐踏約法，於民國二年（1913）發動「二次革命」，但歸於失敗。事後，孫中山逃往日本。孫中山在日本，組織「中華革命黨」，繼續從事反袁活動，並有眾多日本人士加入中華革命黨，協助孫中山從事反袁活動。例如：中華革命軍的東北軍參謀長，即為日本人山中峰太郎。袁世凱政府雖然多次要求日本取締孫中山的「亂黨」活動，但日本對孫中山則刻意加以庇護。民國四年（1915），日本軍部元老上原勇作要求財閥久原房之助將一百萬元交付海軍少將秋山真之、南滿鐵道株式會社官員犬塚信太郎、山田純三郎，令其轉交孫中山作為「反袁」經費。民國四年「二十一條要求」談判期間，孫中山與犬塚信太郎、山田純三郎，於二月五日訂定「中日密約」十一條，同意中國海陸軍採購日式武器，軍隊與各級政府應聘用日本人，中日合設銀行，經營礦山、鐵路、航路應先與日本商議。此一密約隨後曝光，黃興於二月十一日、二十五日兩次通電反對「引狼拒虎」、「倚賴他族」。三月十四日，孫中山仍將密約內容致書日本外務省政務局長小池張造。北京的「申報」也批評孫中山勾結日本人的做法。