在經濟統御上，德川幕府廢除了莊園等級制，通過丈量土地，登記農田面積和勞動力，首先將國土全部歸幕府，然後按照一定的比例分配給各大名，再由大名以俸祿的方式分配給各級武士。幕府將軍統一掌握著對大名的領土分配權，而大名又掌握著對下屬武士的支配權。這不僅是集權化的必然趨勢，也意味著領土私有權的喪失。經濟上的分配是依據幕府與大名所結成的主從等級關係來進行的。在貨幣政策方面，自信長鑄造「大判」（重十兩的金幣）開始，經秀吉而至家康，都知道統一貨幣的重要。隨著德川幕府政權的鞏固，逐漸頒行五種貨幣政策：一、將「大判」十分取其一，作一兩重的「金小判」，充當訂定價格的標準。二、規定銀貨幣的品質，便於買賣交易時使用。三、統一錢幣，且多鑄造。四、頒金銀座制度，禁止私鑄。五、設法集中金銀幣。上述政策在金幣方面是成功的，在銀幣方面則是失敗的。這與日本國內金銀礦產分佈有關（東部產金較多，西部產銀較多），加上德川幕府以前政權的措施，如秀吉時大量開採銀礦，使得京都與西國習慣於使用銀幣。為了因應「江戶用金，大阪用銀」的情況，造成日本國內「兩替業」（換錢業）的發達。根據日本以往的文獻記載，並對照昔時的社會背景得知，在鐮倉末期，已有換錢時取工資的情形，即「替賃」。室町時代即有換錢時抽取一定的成數，並放貸收取利息的情形，即「和利」；此時京都就有了「兩替業」，並有「兩替町」。室町末期，兩替店經營換錢外，又鑑定金銀成色，收取的工資稱為「切賃」，他們日後變為「金座」。江戶開府後，兩替商設在金座附近，當時有「本兩替町」、「新兩替町」（今之銀座街），他們的業務是原先是兌換金、銀和錢，後來則逐漸擴充到「存放款、買賣金銀、融通票據、匯兌、頒佈金銀行情」等業務。兩替商與幕府、大名關係密切，成為幕府與大名重要的融資來源。為了得到開設兩替店的許可，兩替商必須向幕府繳納稅金，但是幕府終究無法取得操控這些兩替業的權力。