農委會表示，加入WTO後，關稅要降低，大概由20％降到12.9％，還有市場要比以前更開放，以前禁止進口的，現在都不能再禁止進口了。依照協商結果，加入WTO之後，除稻米採限量進口，花生、糖等22類農產品採關稅配額進口，蘋果、桃子等18種農產品，則將完全開放自由進口，對本土農業，將造成衝擊。在整體來講，加入WTO第一年，台灣農業產值會降低，估計總產值要降低247億左右。但是前農委會主委彭作奎表示，就總體來看，加入WTO以後的農業產值，會減少10％，就將近400億元。400億元大概等於四次的賀伯颱風，就是我們的農業損失。這樣的結果，不僅可能改變台灣的農產品市場，連帶地也影響到農業結構，而首當其衝的就是稻米農民。依山傍海，素有洋蔥故鄉之稱的屏東枋山，當地農會超市，陳列的不是傲人的本土洋蔥，卻是進口洋蔥。枋山總幹事表示，民國六十年到七十年的洋蔥，百分之九十都外銷，最高的外銷箱數，曾經到二百萬箱，對當時的農民而言，可以說種一分地的洋蔥，可以買一分地。這是農民種植洋蔥，最風光、最賺錢的時候。一個原本大量外銷賺取外匯的產業，在開放進口及國際競爭之後，近年來洋蔥產業快速萎縮，在加入WTO之後，這樣的衝擊將更巨大。加入WTO，按照以前的自由進出口以外，最主要是關稅調降，外國洋蔥價格將會下降，本地蔥農會變成更沒競爭力。但是洋蔥的故事並沒結束，加入WTO之後，蔥農們最擔心的勁敵，來自中國大陸。日本人和台灣人去中國大陸買賣，教他們栽培管理，所以他們的栽培管理有很大的變革，品質當然增加，但是他們栽培的成本，比台灣減少，台灣生產成本比他多六倍。 然而，中國大陸的農業競爭，已非單是農產品的低價傾銷，更嚴重是在農產品加工、經營上，中國大陸以廉價的勞力及技術的取得，在兩岸加入WTO之後，導致重創台灣農業的未來時，台灣農業該如何走？